21世紀，氣墊飛船呼嘯着划過夜空，沖向山谷，沿公路滑翔。
16歲的少年約翰尼·克林頓因為好奇進入了一艘氣墊飛船，航行途中，飛船墜入了大海。幾十條海豚守護着他，從幾百英里外把他送上了大堡礁的一個小島——海豚島。
海豚研究站里的科學家基思博士告訴他，人類一直在努力學習海豚的語言——同時，也設法教會海豚說簡單的英語。
卡贊教授認為，海豚拯救約翰尼是想表明：“我們幫助了你們——現在你們該幫助我們了。”
怎麼幫助海豚呢？觀察衛星發現了海豚群，飛魚號出發了。海豚群也向飛魚號游來，這是人類與非人類生物之間的第一次對話。原來，海豚希望人類能幫助它們抵抗最殘忍的敵人——虎鯨。
諮詢委員會認為可以與虎鯨建立聯繫，改造虎鯨，用虎鯨來控制海豚總數量。試驗的虎鯨形成條件反射不吃海豚了。海豚們也參與了這個實驗。它們也會理解，人類已盡了最大的努力。
暴風雨之夜，小島與大陸失去了聯繫，而卡贊教授得了重病而又無藥治療，約翰尼決定用海豚護送他到大陸。歷盡艱險，終於到達澳大利亞的昆士蘭。紅十字會的直升飛機及時趕到，教授得救了。
教授計劃讓人與海豚合作，譬如捕魚、采珍珠、海上救災、海岸巡邏、沉船探測、水上運動等等——海豚能幫助我們做的事，數也數不清……